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1985 年日本国立琉球大学农学部比嘉照夫教授在经过长时间的精心筛选后，从 1000 多种细菌中选出了以乳酸菌，酵母菌，真菌，放线菌，光合成菌为主的总共 10 属 80 多种对植物，动物和人体有益无害的细菌，把它们组合成了一组能够共生的有用微生物群。比嘉教授把这组共生的细菌称为“有用微生物群”。其英文译文为“ Effective Microorganisms ”，简称为“ＥＭ”。

不同种类的微生物为了自己的生存而分泌和释放不同的物质或代谢产物。这些物质通常可以抑制其它微生物的生长。因此不同种类微生物的共生一直以来都是微生物领域中的一个难题。所以目前有关微生物的应用多为单一菌种的应用。

ＥＭ含有 10 属 80 多种有用微生物（包括厌氧菌和好氧菌），因此如何让它们共生是ＥＭ技术的关键问题，比嘉教授通过引入光合成菌等技术初步解决了这个问题。

光合成菌有非常独特的能量利用系统，在没有化学能的状态下能直接利用光和热，所以能在厌氧和好氧的状态下生存。在两种条件中都能利用光和热能分解有机物，制成糖分，从而消除了某一种微生物的分泌物或代谢产物对另一种微生物的毒性，同时给其它的微生物提供了营养物质，营造出不同种类微生物的共生环境。

每种有用微生物都有自己的反应系。例如，乳酸菌能将蛋白质分解成氨基酸，同时分泌乳酸，抑制有害细菌的繁殖；酵母菌能分解淀粉和蛋白质；真菌能分泌多种有益的生物活性物质；放线菌能抑制有害微生物的繁殖；光合成菌能利用代谢废物制成营养物质以及分解有害的有机物等。ＥＭ含有 80 多种有用微生物，是一个庞大的有用微生物反应系统，因此对植物，动物和人体具有多方面的功效和强大的抗氧化活力。